内设机构有办公室、政策法规处、人事教育处（机关党委）、离退休干部工作处、业务指导处、保管利用处、接收征集处（河南省重大活动档案管理办公室）、科研技术处、编研处。另设有河南省档案学会、《档案管理》杂志社。